Plusieurs possibilités de rangement pour les objets du quotidien ont été pensées dans l'habitacle.
Des bouteilles de 1,5 litre peuvent être rangées dans les bacs de portières avant.
La console centrale comprend deux porte-gobelets et un espace de rangement.
Les sièges arrière bénéficient d'une séparation 2/3-1/3.
Le volume de coffre atteint 410 litres. Comptez 810 litres sièges arrière rabattus (jusqu'au haut des dossiers avant) et 1 289 litres jusqu'au pavillon.
Un Pack Family, avec une banquette arrière coulissante et une trappe à skis, est proposé en option. Les passagers arrière ont la possibilité d'ajuster leur position d'assise sur une course de 150 millimètres, donnant le choix de privilégier la place pour les jambes ou la capacité du coffre à bagages.
Le volume de coffre atteint 520 litres avec la banquette coulissante optionnelle avec des sièges arrière en position avancée.
Les objets de grande longueur peuvent être chargés au travers de la trappe à skis présente au niveau de l'accoudoir arrière.
Le double plancher de coffre optionnel permet d'avoir un plancher plat.
Pour resté connecté, le C3 Aircross propose la fonction Mirror Screen, avec Android Auto, Apple Car Play et MirrorLink. Elle permet de profiter du contenu multimédia et des applications de son smartphone en le dupliquant et en les pilotant depuis l'écran tactile 7 pouces.
La tablette tactile 7 pouces fait office de centre de commandes du véhicule (climatisation, radio, téléphonie, système de navigation).
La navigation 3D connectée avec reconnaissance vocale est associée à des services connectés comme TomTom Traffic qui permet d'avoir les informations sur le trafic en temps réel, la localisation et les prix des stations-service et des parkings, les informations météo, les zones de danger et la recherche locale des points d'intérêt.
La Citroën Connect Box, avec Pack SOS et assistance inclus, permet d'être mis en relation avec un plateau d'assistance spécialisé en cas de panne ou d'accident.
La recharge sans fil pour Smartphone, avec zone de dépose dédiée, permet le rechargement par induction des smartphones ou appareils compatibles au Standard Qi grâce à un tapis de charge intégré dans la console centrale. Il permet aussi d'éviter les câbles. La transmission d'énergie électrique sans fil est basée sur le principe d'induction magnétique.