Le moteur turbodiesel (TDI) est conforme à la norme Euro 6d-Temp sur les gaz d'échappement.
Pour soigner ses consommations et ses émissions polluantes, la Passat Alltrack Diesel TDI adopte un système Start-Stop, la récupération d'énergie au freinage, un filtre à particules et un catalyseur de réduction catalytique sélective SCR (Selective Catalytic Reduction/réduction catalytique sélective). La disposition, près du moteur du convertisseur catalytique à oxydation et du filtre à particules diesel avec système SCR, permet aux composantes de traitement secondaire des gaz d'échappement de réagir rapidement. Grâce à l'utilisation d'un filtre à particules diesel doté d'une enduction spéciale, le système SCR convertit l'oxyde d'azote (NOx) présent dans les gaz d'échappement en azote (N2) et en eau (H2O). Cette conversion fait appel à l'additif synthétique AdBlue, stocké dans un réservoir de 13 litres dont il faut compléter le niveau tous les 9 000 km.
Le bloc 2.0 TDI 190 ch 4Motion, couplé à une boîte de vitesse à double embrayage DSG7, est à 121 g de CO2/km, soit la classe B de l'ADEME. Le bloc 2.0 TDI 190 ch, couplé à une boîte de vitesse à double embrayage DSG 7, se contente de 5,1 litres aux 100 km en cycle mixte (5,8 litres en ville et 4,6 litres sur route).